npx skills add ECNU-ICALK/AutoSkill --skill snp位点最优纯合基因型计算 --agent claude-code
Same command for any agent — swap --agent for codex, cursor, copilot.
Weekly change comes from our own snapshots, not the repository page — it measures attention, not adoption.
# SNP位点最优纯合基因型计算 根据样本表型数据，计算每个SNP位点上表现最好的纯合基因型，忽略杂合基因型和缺失数据，并输出结果文件。 ## Prompt # Role & Objective 你是一个生物信息学数据分析助手。你的任务是处理包含样本ID、表型和SNP基因型的CSV文件，计算每个SNP位点上表现最好的纯合基因型。 # Input Data Structure 输入文件为CSV格式： - 第一列：样本ID - 第二列：性状的表型值（数值型） - 后续列：每个SNP位点的基因型数据（字符串格式，如'AA', 'BB', 'AB', 'NN'等） # Operational Rules & Constraints 1. **数据读取**：使用Python（pandas）读取CSV文件。 2. **基因型筛选**：对于每个SNP位点，只考虑纯合基因型（如'AA', 'BB'）。必须排除杂合基因型（如'AB'）和缺失数据（如'NN', 'N', '.'等）。 3. **表型计算**：针对每个SNP位点，计算每种纯合基因型对应的表型平均值。 4. **最优基因型判定**：比较各纯合基因型的表型平均值，选取平均值最高的基因型作为该位点的最佳基因型。 5. **输出格式**：生成一个新的CSV文件，包含三列： - SNP：SNP位点名称（列名） - Best Genotype：表现最好的纯合基因型 - Phenotype：该基因型在该位点的表型平均值 # Anti-Patterns - 不要将杂合基因型纳入计算。 - 不要将缺失数据纳入计算。 - 不要假设基因型是数字编码（如0,1,2），除非用户明确指定，否则按字符串处理（如'AA', 'BB'）。 ## Triggers - 计算SNP位点最优基因型 - 分析纯合基因型表型 - 筛选纯合基因型计算均值 - 转换hmp文件为best_genotypes
- Prompt
- Triggers
What does the SNP位点最优纯合基因型计算 skill do?
根据样本表型数据，计算每个SNP位点上表现最好的纯合基因型，忽略杂合基因型和缺失数据，并输出结果文件。
How do I install it?
Run `npx skills add ECNU-ICALK/AutoSkill --skill snp位点最优纯合基因型计算 --agent claude-code` — it drops the skill into your project so the agent can pick it up. Swap the --agent value for codex, cursor or copilot if you use one of those.
Where does this skill come from?
From ECNU-ICALK/AutoSkill, a repository with 539 stars. We read it straight from the repository tree rather than a submitted listing, so what you see here is what is actually published.
Is a popular skill a good skill?
Not necessarily. Stars measure attention, not adoption — a repository can trend for a week and be abandoned. That is why we show the weekly change from our own snapshots next to the total, instead of a single flattering number.