phenotype-lab-spec
研究対象集団・アウトカムのフェノタイプ定義と検査値活用仕様を作成する。 コンピューター実行可能なアルゴリズム形式で記述し、バリデーション計画を含める。
npx skills add majiayu000/claude-skill-registry --skill phenotype-lab-spec-tito-gh-healthcare-2 --agent claude-code
Same command for any agent — swap --agent for codex, cursor, copilot.
Weekly change comes from our own snapshots, not the repository page — it measures attention, not adoption.
# Phenotype & Lab Specification Skill ## 目的 研究対象集団（曝露、アウトカム、共変量）をEHRデータから正確に同定するためのコンピューター実行可能なフェノタイプ定義と検査値活用仕様を作成する。 ## 入力パラメータ | パラメータ | 必須 | 説明 | 例 | |-----------|------|------|-----| | PHENOTYPE_NAME | Yes | フェノタイプ名 | NDMM TIE patient | | DRUG | Yes | 対象薬剤 | daratumumab | | INDICATION | Yes | 対象疾患 | multiple myeloma | | PHENOTYPE_TYPE | Yes | 種類 | population/exposure/outcome/covariate | | REFERENCE_DEFINITION | No | 参照定義（ガイドライン等） | IMWG criteria | ## フェノタイプ定義フレームワーク ### 1. 対象集団フェノタイプ（Population Phenotype） #### 構成要素 ``` Population Phenotype = Disease Phenotype ∩ Eligibility Criteria ∩ Exclusion Criteria ``` #### 疾患フェノタイプ定義テンプレート ```yaml disease_phenotype: name: "{INDICATION}" definition: primary: - type: diagnosis_code codes: - ICD10: ["C90.0", "C90.00", "C90.01", "C90.02"] timeframe: "any time before index" occurrence: ">= 1" supporting: - type: medication drug_class: "myeloma_agents" timeframe: "any time" - type: lab_value test: "M_protein" value: "> 0" validation: ppv_target: ">= 0.80" sensitivity_target: ">= 0.70" ``` ### 2. 曝露フェノタイプ（Exposure Phenotype） #### New User定義テンプレート ```yaml exposure_phenotype: name: "{DRUG}_new_user" definition: exposure: - type: prescription drug:
- 目的
- 入力パラメータ
- フェノタイプ定義フレームワーク
- 1. 対象集団フェノタイプ（Population Phenotype）
- 2. 曝露フェノタイプ（Exposure Phenotype）
- 3. アウトカムフェノタイプ（Outcome Phenotype）
- 4. 共変量フェノタイプ（Covariate Phenotype）
- 検査値活用仕様
- 検査値マッピング
- 時系列検査値の処理
- 出力フォーマット
- クレームDB差別化ポイント
- 本仕様でのみ可能な定義
- 注意事項
What does the phenotype-lab-spec skill do?
研究対象集団・アウトカムのフェノタイプ定義と検査値活用仕様を作成する。 コンピューター実行可能なアルゴリズム形式で記述し、バリデーション計画を含める。
How do I install it?
Run `npx skills add majiayu000/claude-skill-registry --skill phenotype-lab-spec-tito-gh-healthcare-2 --agent claude-code` — it drops the skill into your project so the agent can pick it up. Swap the --agent value for codex, cursor or copilot if you use one of those.
Where does this skill come from?
From majiayu000/claude-skill-registry, a repository with 534 stars. We read it straight from the repository tree rather than a submitted listing, so what you see here is what is actually published.
Is a popular skill a good skill?
Not necessarily. Stars measure attention, not adoption — a repository can trend for a week and be abandoned. That is why we show the weekly change from our own snapshots next to the total, instead of a single flattering number.